Классификация и номенклатура ферментов: систематические и рабочие названия, коферменты (по классами специфичности – типу реакции)
Классификация ферментов:
1) Оксидоредуктазы.
Катализируют окислительно-восстановительные реакции. В реакцию вступают 2 вещества и 2 образуются, одно окисляется, другое восстанавливается: Sвост + S’окисл ↔ S’вост + Sокисл
a. дегидрогеназы (отщепляют Н от субстратов)
b. оксидазы (переносят Н с субстрата на кислород),
c. оксигеназы (включают кислород в молекулу субстрата)
d. гидроксипероксидазы (разрушают перекиси водорода и органические перекиси).
Систематическое название: донор: акцептор – оксидоредуктаза
Тривиальное название: донордегидрогеназа.
Шифр: КФ 1.1.1.1
Пример: Пируват + НАДН2 ↔ лактат + НАД+
Систематическое название: Лактат: НАД+ оксидоредуктаза
Тривиальное название: ЛДГ. Шифр: КФ 1.1.1.1
2) Трансферазы
Принимают участие в переносе атомных групп, молекулярных остатков от одного соединения к другому. В реакцию вступают 2 вещества и 2 образуются: S-G + S’ ↔ S + S’-G.
a. фосфотрансферазы (киназы)
b. аминотрансферазы
c. гликозилтрансферазы
d. метилтрансферазы
e. ацилтрансферазы.
Систематическое название: откуда: куда - в какое положение–что–трансфераза или донор: акцептор–транспортируемая группа– трансфераза
Тривиальное название: кудакиназа
Шифр: 2.1.1.1
Пример: АТФ + D-гексоза ↔ АДФ + D- гексоза-6ф
Систематическое название: АТФ: D-гексоза-6-фосфотрансфераза
Тривиальное название: гексокиназа
3) Гидролазы.
Расщепляют ковалентную связь с присоединением молекулы воды. В реакцию вступают 2 вещества и 2 образуются: S-G + Н2О ↔ S-ОН + G-Н.
a. гликозидазы – гидролиз гликозидов (лактоза – лактаза, мальтоза – мальтаза, сахароза – сахараза)
b. пептидазы – гидролиз пептидных связей
c. эстеразы – разрыв связи в сложных эфирах.
Систематическое название субстрат–что отщепляется–гидролаза или субстрат–гидролаза
Тривиальное название: субстрат-что отщепляетсяаза
Шифр: 3.1.1.1
Пример: Глюкозо-6ф + Н2О → глюкоза + Н3РО4
Систематическое название: Глюкозо-6ф-фосфогидролаза
Тривиальное название: Глюкозо-6ф-фосфотаза
4) Лиазы
Отщепление групп от субстратов по негидролитическому механизму с образованием двойных связей (или наоборот, присоединение по двойной связи). Реакции обратимы, за исключением отщепления СО2. В реакцию вступает 1 вещество и 2 образуются (или наоборот): -SХ-SY- ↔ XY + -S=S-
Систематическое название: субстрат: что отщепляется–лиаза
Тривиальное название: продуктаза
Шифр: 4.1.1.1
Пример: L-малат ↔ фумарат + Н2О
Систематическое название: L-малат: гидро–лиаза
Тривиальное название: фумараза
5) Изомеразы
Взаимопревращения оптических, геометрических, позиционных изомеров. В реакцию вступает 1 вещество и 1 образуется.
a. Рацемазы
b. Эпимеразы
c. Таутамеразы
d. цис,- трансизомеразы
e. мутазы (при внутримолекулярном переносе группы)
f. цикло-, оксоизомеразы.
Систематическое название субстрат–вид изомеризации–изомераза или субстрат–продукт–изомераза
Шифр: 5.1.1.1
Пример: гл-6ф ↔ фр-6ф
Систематическое название: гл-6ф–фр-6ф–изомераза
6) Лигазы (синтетазы)
Соединение 2 молекул с использованием энергии макроэргических соединений (АТФ и др). В реакцию вступают 3 вещества, образуется 3 вещества.
Систематическое название: субстрат: субстрат–лигаза (источник энергии)
Тривиальное название: субстратсубстратлаза
Шифр: 6.1.1.1
Пример: АТФ + ПВК + СО2 → АДФ + Фн + ЩУК
Систематическое название: ПВК: СО2–лигаза (АТФ → АДФ + Фн)
Тривиальное название: пируваткарбокилаза
Коферменты:
Выступает в роли акцептора и донора химических группировок.
Локализуется в каталитическом участке активного центра.
· Простестическая группа – кофермент связан с белковой частью молекулы ковалентными связями. Связь прочная. Есть некоторые коферменты, связанные нековалентными связями, но являющиеся очень прочными.
· Связь нековалентная - временное взаимодействие на время химической реакции, может рассматриваться в качестве второго субстрата.
К коферментам относятся:
· гемы,
· нуклеотиды,
· коэнзим Q,
· ФАФС,
· SAM,
· Глутатион
· производные водорастворимых витаминов:
Витамины | Коферменты |
РР (никотиновая кислота) | НАД+, НАДФ+ |
В2 (рибофлавин) | ФАД, ФМН |
В6 (пиридоксаль) | Пиридоксальфосфат |
В1 (тиамин) | Тиаминпирофосфат |
В12 | Кобаламины |
Дата добавления: 2016-06-29; просмотров: 4604;