Геномная организация генов, кодирующих иммуноглобулины

Огромное разнообразие молекул иммуноглобулинов в пределах каждого класса обусловлено:

Ø во-первых, большим количеством генов, кодирующих разные участки (константные и вариабельные) тяжелых и легких цепей иммуноглобулинов,

Ø во-вторых, определенными изменениями,происходящими в геноме незрелых В-лимфоцитов в процессе их деления и созревания.

Для человека и млекопитающих животных известны 3 группы сцепления генов, кодирующих иммуноглобулины. Эти группы сцепления расположены в разных парах хромосом. В частности, существует группа сцепления генов, кодирующих тяжелые цепи, и две разные группы сцепления, кодирующие c- и l-типы легких цепей. Каждая группа сцепления, в свою очередь, представлена большим количеством генов, одни из которых кодируют вариабельную область цепи (V-гены), а другие – константную область (С-гены). Причем эти V- и С-гены какой-то определенной группы сцепления изначально (в незрелом В-лимфоците) находятся на значительном расстоянии друг от друга. Подобная нативная локализация генов, кодирующих цепи иммуноглобулинов, определяется как состояние зародышевой линии (англ. germline). Однако по мере созревания В-лимфоцитов и соответственно перехода их от некоммитированных предшественников к коммитированым формам, проявляющим определенную специфичность, происходит реорганизация генома, так что пространственно удаленные гены оказываются расположенными в непосредственной близости друг от друга, образуя единый информационный участок. Такая реорганизация генома получила название соматической рекомбинации и осуществляется путем делеции (вырезания) определенных генов в группе сцепления, в результате чего далеко отстоящие гены оказываются расположенными друг возле друга. Соматическая рекомбинация затрагивает только лишь определенные соматические клетки (в нашем случае развивающиеся В-лимфоциты), не происходит в половых клетках, а, следовательно, не наследуется.

Группа сцепления, ответственная за синтез легкой цепи c-типа, включает три группы генов:

ü 250 генов, кодирующих область вариабельного домена c-цепи (Vc-гены), состоящую из 94-95 аминокислотных остатков. Причем каждому Vc-гену в полинуклеотидной последовательности обязательно предшествует т.н. лидерный участок (L-ген), кодирующий т.н. лидерный пептид, состоящий из 20-25 аминокислотных остатков, обладающий гидрофобностью и облегчающий прохождение молекулы иммуноглобулина через мембрану гранулярного эндоплазматического ретикулума. Лидерный пептид присущ только незрелой молекуле иммуноглобулина, после прохождения этой незрелой молекулы через мембрану эндоплазматического ретикулума он отщепляется. Каждому из 250 Vc-генов предшествует один и тот же L-ген.

ü 5 J-мини-генов (от англ. "joining"), кодирующих аминокислотную последовательностьиз 12-14 аминокислот, достраивающую вариабельный домен. Один из этих 5 J-мини-генов является неактивным и в связи с этим называется псевдогеном

ü один ген, кодирующий константную область c-цепи (Сc-ген).

Рис. Рекомбинация генов, кодирующих c-цепь иммуноглобулинов. В некоммитированном В-лимфоците гены, кодирующие c-цепь иммуноглобулинов, отдалены друг от друга в ДНК на значительное расстояние. Процесс рекомбинации начинается с объединения одного из 250 V-генов (в данном случае V_c2) с одним из 5 J-мини-генов (в данном случае J4). В результате формируется c-локус, контролирующий незрелую пре-мРНК ядра. При созревании такой РНК происходит процессинг пре-мРНК, в ходе которого вырезаются ее участки, комплементарные областям ДНК, расположенным между кодирующими генами c-локуса. Затем участки РНК, комплементарные LV_c2J4 и С_c -генам объединяются в результате сплайсинга, что приводит к образованию зрелой мРНК, транслирующей первичную структуру c-цепи. При созревании c-цепи лидерная полипептидная последовательность удаляется, что и приводит к формированию окончательной c-цепи.

Процесс рекомбинации начинается с объединения одного из 250 Vc-генов с одним из 5 J-мини-генов (за счет делеции участков ДНК между этими генами) и осуществляется случайным образом. Место рекомбинации V-J не является жестко фиксированным: объединение между определенными V- и J-геном может происходить как между собственно их основаниями, так и между областями, соседствующими с этими V- и J-генами. Подобные "ошибки" вносят дополнительную изменчивость в третью гипервариабельную область вариабельного домена легкой цепи. Образовавшийся вследствие делеций информационный участок V_icJ_ic далее путем делеций объединяется с Сc-геном, в результате чего формируется c-локус, состоящий из трех экзонов (кодирующих участков):

ü L-гена, кодирующего лидерный пептид

ü рекомбинантного V_icJ_ic-гена, кодирующего вариабельный домен легкой χ-цепи

ü Сc-гена,кодирующего константный домен легкой χ-цепи.

Определенная структура возникающего вследствие рекомбинации генома c-локуса и будет обуславливать специфику вариабельного домена синтезируемой в таком В-лимфоците c-цепи. Рекомбинантная ДНК в коммитированном на определенный антиген В-лимфоците обеспечивает образование первичного транскрипта – пре-мРНК ядра, включающей полинуклеотидные последовательности, считанные как с трех экзонов c-локуса (L-гена, рекомбинантного V_icJ_ic-генаи Сc-гена), так и с некодирующих участков (интронов), находящихся между L-геномирекомбинантным V_icJ_ic-геном,а также междуV_icJ_ic-геноми Сc-геном.Образовавшаяся пре-мРНК ядрадалее (еще до выходя из ядра) подвергается созреванию, включающему

ü процессинг пре-мРНК ядра, в ходе которого из нее вырезаются интронные участки

ü сплайсинг экзонных участков пре-мРНК,в результате которого образуется зрелая мРНК иммуноглобулина, покидающая ядро и транслирующаяся на рибосомах, связанных с мембраной эндоплазматического ретикулума.

Группа сцепления генов, кодирующих легкую цепь l-типа, представлена генами, локализованными в двух локусах, каждый из которых содержит:

ü один L-ген (обозначаемые L₁-ген в первом локусе и L₂-ген во втором локусе)

ü один V_l-ген (обозначаемые V_l1-ген в первом локусе и V_l2-ген во втором локусе)

ü два J_l-мини-гена (обозначаемые J_l1- и J_l2 –гены в первом локусе и J_l3- и J_l4 –гены во втором локусе)

ü два С_l-гена (обозначаемые С_l1- и С_l2 –гены в первом локусе и С_l3- и С_l4 –гены во втором локусе).

Гены J_l4 и С_l4, заложенные во втором локусе, являются псевдогенами (функционально не активны).

Несмотря на несколько иную организацию группы сцепления, кодирующей легкую цепь l-типа,процессы рекомбинации ДНК при созревании В-лимфоцитов и последующего созревания пре-мРНК ядра происходят аналогично таковым при синтезе легкой χ-цепи. При этом возможны следующие варианты рекомбинантной ДНК и соответственно разные типы антител, кодируемых ими:

ü L₁ V_l1 J_l1 С_l1

ü L₁ V_l1 J_l2 С_l2

ü L₂ V_l2 J_l3 С_l3

Образование еще одного теоретически возможного варианта – L₂ V_l2 J_l4 С_l4 – практически никогда не осуществляется, поскольку гены J_l4 и С_l4 являются не активными.

Рис. Геномная организация генов, кодирующих легкую цепь иммуноглобулинов l-типа. l-цепь кодируется двумя локусами, каждый из которых включает один L-ген, один V_l-ген, два J_l-мини-гена и два С_l-гена. В локусе 2 гены J_l4 и С_l4 являются функционально неактивными (псевдогенами).

Тяжелые цепиразных изотипов (a, g, m, d, e) кодируются следующими группами генов:

ü группой генов, кодирующих вариабельный домен тяжелой цепи (V-домен).Эта группа включает следующие гены:

· 500 V-генов, каждому из которых предшествует свой L-ген, кодирующий лидерный пептид

· 15 D-мини-генов