Репарация ошибок репликации ДНК путем метилирования.

Ошибки спаривания азотистых оснований во время репликации ДНК происходят достаточно часто (у бактерий один раз на 10 тыс. нуклеотидов), в результате которых в дочернюю цепь ДНК включаются некомплементарные нуклеотидам материнской цепи нуклеотиды - мисмэтчи (англ. mismatch - не соответствовать).

В этом случае репарация происходит с использованием определенной системы, связанной с метилированием ДНК. Действие этой системы репарации основано на том, что после репликации через определенное время (несколько минут) ДНК подвергается метилированию. Метилируется в основном аденин с образованием N6-мeтил-аденина.При этом вновь синтезированная (дочерняя) цепь остается неметилированной. Если в такой цепи есть неспаренные нуклеотиды, то она подвергается репарации. В устранении неспаренных нуклеотидов в полуметилированной молекуле ДНК принимает участие комплекс ферментов репарации, который сканирует поверхность молекулы ДНК, вырезает участок дочерней цепи, прибегающей к мисмэтчам, а затем создает условия для застраивания его нужными (комплементарными) нуклеотидами. Различные компоненты этого комплекса обладают разными активностями нуклеазной (необходима для внесения разрывов в ДНК и выщепления нуклеотидов), хеликазной (расплетание двойной спирали ДНК), АТФазной (энергетическое обеспечение движения комплекса вдоль репарируемой части молекулы).

Сходный по структуре и функциям комплекс ферментов репарации выявлен и у человека.

4. Рекомбинантная (пострепликативная) репарация у бактерий.

В тех случаях, когда по тем или иным причинам вышерассмотренные системы репарации оказываются нарушенными, в цепях ДНК могут образовываться бреши (недорепарированные участки), имеющие существенные размеры, что может привести к нарушением системы репликации и гибели клеток. В этом случае клетка в состоянии использовать для репарации одной молекулы ДНК другую полученную после репликации молекулу ДНК, т. е. привлечь для этой цели механизм рекомбинации.

У бактерий в рекомбинантной репарации принимает участие белок Rec А, связывающийся с одноцепочечным участком ДНК и вовлекающий его в рекомбинацию с комплиментарными участками неповрежденных цепей другой молекулы ДНК. В результате и разорванная (содержащая бреши), и неповрежденная цепи репарируемой молекулы ДНК оказываются спаренными с неповрежденными комплементарными участками ДНК, что открывает возможность репарации путем описанных выше систем.

5. SOS-репарация.

Существование этой системы впервые постулировал М. Радман в 1974 г. Он же дал название этому механизму, включив в него международный сигнал бедствия "SOS". Эта система включается тогда, когда повреждений в ДНК становится настолько много, что угрожает жизни клетки. В этом случае происходит индукция активности разнообразной группы генов, задействованных в различных клеточных процессах, сопряженных с репарацией ДНК. Включение тех или иных генов, определяемых количеством повреждений в ДНК, приводит к разным по значимости клеточным ответам (начиная со стандартной репарации поврежденных нуклеотидов и заканчивая подавлением клеточного деления).